Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay

El recuento de huevos de nematodos gastrointestinales (NGI) en heces es el método más utilizado para estimar la carga parasitaria en ovinos. La composición de las especies se realiza mediante coprocultivos y clasificación morfológica de las larvas infectantes (L3) obtenidas, lo cual es laborioso y d...

ver descrição completa

Na minha lista:
Detalhes bibliográficos
Autor principal: Pimentel Barreto, Sabrina (author)
Formato: masterThesis
Idioma:espanhol
Publicado em: 2020
Assuntos:
Acesso em linha:https://hdl.handle.net/20.500.12008/27248
Tags: Adicionar Tag
Sem tags, seja o primeiro a adicionar uma tag!
_version_ 1868889969240571904
author Pimentel Barreto, Sabrina
author_browse Pimentel Barreto, Sabrina
author_facet Pimentel Barreto, Sabrina
author_role author
collection COLIBRI
dc.contributor.none.fl_str_mv Pimentel Barreto Sabrina, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Veterinaria
dc.creator.none.fl_str_mv Pimentel Barreto, Sabrina
dc.date.none.fl_str_mv 2020
2021-04-26T12:20:34Z
2021-04-26T12:20:34Z
dc.format.none.fl_str_mv 86 p.
application/pdf
dc.identifier.none.fl_str_mv Pimentel Barreto, S. Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay [en línea] Tesis de maestría. Montevideo : Udelar. FV, 2020.
https://hdl.handle.net/20.500.12008/27248
dc.language.none.fl_str_mv es
spa
dc.publisher.none.fl_str_mv Udelar. FV
dc.rights.none.fl_str_mv info:eu-repo/semantics/openAccess
Licencia Creative Commons Atribución - No Comercial - Sin Derivadas (CC - By-NC-ND 4.0)
dc.source.none.fl_str_mv reponame:COLIBRI
instname:Universidad de la República
instacron:Universidad de la República
dc.subject.none.fl_str_mv OVINOS
PARASITOLOGÍA
NEMÁTODOS
URUGUAY
dc.title.none.fl_str_mv Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay
dc.type.none.fl_str_mv Tesis de maestría
info:eu-repo/semantics/masterThesis
info:eu-repo/semantics/acceptedVersion
description El recuento de huevos de nematodos gastrointestinales (NGI) en heces es el método más utilizado para estimar la carga parasitaria en ovinos. La composición de las especies se realiza mediante coprocultivos y clasificación morfológica de las larvas infectantes (L3) obtenidas, lo cual es laborioso y demorado. Actualmente se dispone de métodos moleculares, los cuales proclaman ser más rápidos y eficientes. El objetivo de esta tesis fue poner a punto una PCR convencional para la tipificación de géneros y especies de NGI más prevalentes de ovinos y una PCR en tiempo real (qPCR) para la tipificación y cuantificación del género Haemonchus. Los ensayos se basaron en combinaciones de cebadores y sondas específicas de género de NGI derivadas de la segunda unidad de transcripción de ADN ribosómico nuclear del espaciador transcrito interno (ITS2). Como ADN molde se utilizó ADN genómico de huevos y larvas infectantes de NGI. Para ello, se obtuvieron 24 muestras de materia fecal de ovinos en pastoreo de distintas razas y categorías. En este estudio se logró exitosamente el desarrollo y validación de los protocolos de PCR convencional para Haemonchus contortus, Teladorsagia circumcincta y Trichostrongylus spp., identificándose bandas de 106 pb, 226 pb y 147 pb para cada uno de los respectivos NGI. Asimismo, se observó que los mejores resultados se obtienen cuando se utilizó ADN de larvas infectantes provenientes de coprocultivos. El análisis de Kappa de Cohen para concordancia entre la clasificación morfológica de las L3 y PCR fue de 82,4% (p=0.000) indicando excelente acuerdo entre ambos métodos. Este trabajo también indicó que es posible un diagnóstico confiable mediante qPCR de Haemonchus sp., utilizando ADN extraído directamente de huevos recolectados de materia fecal. Se encontró una correlación positiva y alta (R2= 0,75, p<0,05) entre los recuentos de huevos por gramo y cuantificación de ADN de Haemonchus sp. en la qPCR, sugiriendo que la cuantificación de este género mediante qPCR, es factible. Sin embargo, son necesarios más estudios, fundamentalmente en la extracción de ADN de huevos de estrongílidos de ovinos y cuantificación de los otros NGI prevalentes en ovinos. En conclusión, los resultados presentados en esta tesis muestran que las pruebas moleculares pueden ser incluidos en los estudios sobre NGI de los ovinos.
eu_rights_str_mv openAccess
format masterThesis
id anni_183fd329ebd44ef8bbeea6523a95a1c9
identifier_str_mv Pimentel Barreto, S. Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay [en línea] Tesis de maestría. Montevideo : Udelar. FV, 2020.
instacron_str Universidad de la República
institution Universidad de la República
instname_str Universidad de la República
language spa
language_invalid_str_mv es
network_acronym_str anni
network_name_str oai-lr-anni
oai_identifier_str oai:colibri.udelar.edu.uy:20.500.12008/27248
publishDate 2020
publishDateSort 2020
publisher.none.fl_str_mv Udelar. FV
reponame_str COLIBRI
repository.mail.fl_str_mv
repository.name.fl_str_mv
repository_id_str
rights_invalid_str_mv Licencia Creative Commons Atribución - No Comercial - Sin Derivadas (CC - By-NC-ND 4.0)
spelling Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en UruguayPimentel Barreto, SabrinaOVINOSPARASITOLOGÍANEMÁTODOSURUGUAYEl recuento de huevos de nematodos gastrointestinales (NGI) en heces es el método más utilizado para estimar la carga parasitaria en ovinos. La composición de las especies se realiza mediante coprocultivos y clasificación morfológica de las larvas infectantes (L3) obtenidas, lo cual es laborioso y demorado. Actualmente se dispone de métodos moleculares, los cuales proclaman ser más rápidos y eficientes. El objetivo de esta tesis fue poner a punto una PCR convencional para la tipificación de géneros y especies de NGI más prevalentes de ovinos y una PCR en tiempo real (qPCR) para la tipificación y cuantificación del género Haemonchus. Los ensayos se basaron en combinaciones de cebadores y sondas específicas de género de NGI derivadas de la segunda unidad de transcripción de ADN ribosómico nuclear del espaciador transcrito interno (ITS2). Como ADN molde se utilizó ADN genómico de huevos y larvas infectantes de NGI. Para ello, se obtuvieron 24 muestras de materia fecal de ovinos en pastoreo de distintas razas y categorías. En este estudio se logró exitosamente el desarrollo y validación de los protocolos de PCR convencional para Haemonchus contortus, Teladorsagia circumcincta y Trichostrongylus spp., identificándose bandas de 106 pb, 226 pb y 147 pb para cada uno de los respectivos NGI. Asimismo, se observó que los mejores resultados se obtienen cuando se utilizó ADN de larvas infectantes provenientes de coprocultivos. El análisis de Kappa de Cohen para concordancia entre la clasificación morfológica de las L3 y PCR fue de 82,4% (p=0.000) indicando excelente acuerdo entre ambos métodos. Este trabajo también indicó que es posible un diagnóstico confiable mediante qPCR de Haemonchus sp., utilizando ADN extraído directamente de huevos recolectados de materia fecal. Se encontró una correlación positiva y alta (R2= 0,75, p<0,05) entre los recuentos de huevos por gramo y cuantificación de ADN de Haemonchus sp. en la qPCR, sugiriendo que la cuantificación de este género mediante qPCR, es factible. Sin embargo, son necesarios más estudios, fundamentalmente en la extracción de ADN de huevos de estrongílidos de ovinos y cuantificación de los otros NGI prevalentes en ovinos. En conclusión, los resultados presentados en esta tesis muestran que las pruebas moleculares pueden ser incluidos en los estudios sobre NGI de los ovinos.Udelar. FVPimentel Barreto Sabrina, Universidad de la República (Uruguay). Facultad de Veterinaria2021-04-26T12:20:34Z2021-04-26T12:20:34Z2020Tesis de maestríainfo:eu-repo/semantics/masterThesisinfo:eu-repo/semantics/acceptedVersion86 p.application/pdfPimentel Barreto, S. Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay [en línea] Tesis de maestría. Montevideo : Udelar. FV, 2020.https://hdl.handle.net/20.500.12008/27248reponame:COLIBRIinstname:Universidad de la Repúblicainstacron:Universidad de la RepúblicaesspaLas obras depositadas en el Repositorio se rigen por la Ordenanza de los Derechos de la Propiedad Intelectual de la Universidad de la República.(Res. Nº 91 de C.D.C. de 8/III/1994 – D.O. 7/IV/1994) y por la Ordenanza del Repositorio Abierto de la Universidad de la República (Res. Nº 16 de C.D.C. de 07/10/2014)info:eu-repo/semantics/openAccessLicencia Creative Commons Atribución - No Comercial - Sin Derivadas (CC - By-NC-ND 4.0)oai:colibri.udelar.edu.uy:20.500.12008/272482026-04-14T10:32:30Z
spellingShingle Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay
Pimentel Barreto, Sabrina
OVINOS
PARASITOLOGÍA
NEMÁTODOS
URUGUAY
status_str acceptedVersion
title Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay
title_full Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay
title_fullStr Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay
title_full_unstemmed Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay
title_short Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay
title_sort Puesta a punto y validación de metodologías basadas en ADN para diagnóstico de nemátodos gastrointestinales de ovinos en Uruguay
topic OVINOS
PARASITOLOGÍA
NEMÁTODOS
URUGUAY
url https://hdl.handle.net/20.500.12008/27248